Denominazione della strumentazione

Infrastruttura HPC per lo sviluppo di farmaci

Ditta fornitrice

E4 Computer Engineering spa

Principali funzionalità e campi applicazione

Descrizione sintetica

Infrastruttura computazionale ad alte prestazioni per il supporto a studi di hit identification e hit-2-lead optimisation. La macchina è equipaggiata con 2 processori AMD EPYC™ 7713 con 64 cores ciascuno e 4 schede grafiche NVIDIA™ RTX A6000.

Applicazioni generali

La macchina permette di accelerare l’identificazione di molecole bioattive tramite lo screening virtuale di molecole.

Il virtual screening accelera la scoperta dei farmaci attraverso diversi vantaggi chiave:

  • Esame Rapido di Miliardi di Composti: Utilizzo di algoritmi computazionali per filtrare una vasta libreria di composti.
  • Riduzione dei Tempi e Costi: Processo molto più veloce ed economico rispetto ai metodi tradizionali.
  • Selezione dei Candidati Promettenti: Identificazione mirata dei composti con maggiore affinità per il target biologico.
  • Aumento dell’Efficienza: Concentrazione delle risorse sui composti più promettenti.
  • Adattabilità: Facilmente aggiornabile e adattabile a diverse classi di target e nuove informazioni scientifiche.

Applicazioni tecnologiche e industriali

Offrire un’infrastruttura HPC per il virtual screening ai clienti industriali porta diversi vantaggi:

  • Elevata Potenza Computazionale: Screening rapido di miliardi di composti.
  • Riduzione dei Costi: Nessun investimento in hardware costoso e riduzione dei costi operativi.
  • Accelerazione della Scoperta: Tempi di screening ridotti, con focus su molecole promettenti.
  • Software Avanzato: Accesso a algoritmi e modelli all’avanguardia.
  • Flessibilità: Soluzioni personalizzate per diverse esigenze progettuali.
  • Supporto Esperto: Assistenza tecnica e scientifica continua.
  • Sicurezza dei Dati: Protezione avanzata e gestione efficiente dei dati.

Questi benefici rendono l’infrastruttura HPC un’opzione preziosa per accelerare e migliorare il processo di scoperta dei farmaci.

Tecniche disponibili

  • Structure-based Virtual Screening
  • Ligand-based Virtual Screening
  • Algoritmi di machine learning per classificazione di molecole, predizione di proprietà e generazione di nuove strutture
  • Dinamica Molecolare
  • Calcoli di energia libera

Ubicazione

Campus Mattei, Località Ca’ le Suore

Stanza: Vano Tecnico B

Docente di riferimento

Prof. Giovanni Bottegoni (giovanni.bottegoni@uniurb.it)

Modalità di accesso/fruizione

Richiesta al Prof. Bottegoni per l’ottenimento di un account: giovanni.bottegoni@uniurb.it